1.干穴。（1）原因。基质装得过于疏松，可装盘时基质水分少，或基质装好后放一段时间才播种漂盘，便会出现有些孔穴基质干燥、不吸水，种子不出苗的现象，即干穴现象。（2）预防措施。应该现装、现播、现漂盘，要注意装盘时控制好基质水分，既不能过干，也不能过于潮湿，并将各孔穴内的基质稍加压实，不能过松。（3）补救方法。出现干穴后，如果还未出苗，应及时用手压实孔穴，补足不够的基质，重新播种，从上浇水使孔穴中基质潮湿，以加快水分上渗的速度；如果形成空穴的烟苗过小，到定苗时再移植烟苗。

2.螺旋根。所谓螺旋根是用来描述一种不具有正常的向地性和未扎入营养基质内部的烟苗根部的术语。幼苗一旦生出螺旋根，通常不能生长发育成适合移栽的烟苗。（1）产生螺旋根的原因。播种过浅或装填基质时压得过实；种子直接播在基质表面，出芽后由于基质表面的肥水条件就可满足烟苗的生长，因此，根系成螺旋状盘旋在基质表面，而不向下生长；基质装得过坚实，烟苗根系不向下生长，也会产生螺旋根。（2）预防方法。装填基质时要松紧适度，用手指轻压不再下落即可；播种浓度不超过0.5厘米，以基质表面刚好看不到种子为宜。

3.盐渍。（1）原因。育苗棚温度过高、温度过低以及过分的空气流动，致使基质表面水分大量蒸发，造成盐分积累，基质表面发白。（2）易产生盐渍的时期。易发生在出苗至大十字期前，此时烟苗利用养分少，盐分易于富积到基质中，随盘面水分蒸发而积累到基质表面。超渍严重时易造成烟苗死亡。（3）消除方法。当发现苗盘表面发白、有大量盐分析出时，通过对基质表面反复喷清水淋溶，即可消除盐害。

4.蓝绿藻。（1）原因。营养液中磷肥浓度过高；育苗盘和基质消毒不彻底；遮阳网管理不到位；池水长期暴露于光照下。（2）消除方法。要严格控制营养液中磷肥浓度，氮与磷比例以1:1.5为宜；严格对育苗盘、基质、池水进行消毒，规范装盘操作；避免池水长时间暴露于光照下；出现蓝绿藻时喷0.025%硫酸铜灭藻。

5.冷害。冷害是指冰点以上的低温对烟苗造成的伤害。（1）原因。育苗后，由于受倒春寒影响，气温不稳定，有时会出现持续寒流，棚温夜间陡降，造成幼苗受到冷害。（2）症状。烟苗叶片边缘内卷或舌状伸展，舌状叶和心叶颜色发白或浅黄色，甚至出现烟苗畸形，生长停止。冷害发生后，一般经过连续4-5天温暖条件，烟苗便能自行恢复正常生长。（3）解决办法。喷施0.05%-0.1%硫酸锌，对缓解症状有一定作用。

6.冰雪天气影响。在烤烟育苗前期，部分烟区会出现雨雪天气，对出苗及生长造成不利影响。因此，当气象预报有强降温来临或遭遇降雪等低温危害时，首要措施是把漂浮池的水加到10厘米以上，这样水的热容量大，使育苗池水保持一定深度，能有效缓解低温危害。其次是在小棚表面加盖草席等材料保温，以减轻低温危害。此外，长时间受低温影响，当气温回升后，应减少池水量，或将育苗盘抬出育苗池，使基质温度和池水温度尽快回升，促进烟苗生长。

7.病虫害防治。烤烟漂浮育苗病虫害防治要以预防为主，做好育苗前的各项消毒工作，消除病源，控制发病条件。重点做好育苗场地、育苗棚、基质、育苗盘等消毒工作，一旦发现病源要及时清除，同时喷施防治药剂，以防蔓延。具体做法是：（1）育苗棚内外保持清洁。育苗棚四周应排水良好，地势干燥，没有杂草，育苗棚走道最好为水泥地。（2）严格人员消毒。人体是病害的传播媒介之一，特别是烟草花叶病毒和土壤传播的病害，可随泥土带入。进入育苗区和育苗棚的人员最好先对鞋底用10%漂白剂溶液时行浸湿消毒。（3）严禁吸烟。卷烟可传播花叶病，因此在育苗棚应杜绝吸烟。（4）注意通风，以降低空氯温度，保持叶片干燥和减少病菌的传染。（5）清除病株。在育苗过程中，一旦发现病株要及时清除，同时对未染病烟苗喷施相应药剂进行预防。